シマトネリコは自然樹形を基本としますので剪定は、不用な枝などを整理する透かし剪定が中心となります。 剪定する枝は、見た目にバランスの悪い枝、不要な枝（徒長枝、下り枝、ふところ枝）などで、 上方向など、伸ばしたくない方向の枝や、短くしたい枝なども剪定で調整します。 またシマトネリコは強い剪定にも耐え、刈り込みなどにも耐えます。ただし寒冷地では冬場に半分くらい落葉することもあります。